Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

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Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP7Q93009 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP7Q93009 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP7Q93009 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP7Q93009 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP7Q93009 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP7Q93009 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP7Q93009 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP7Q93009 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP7Q93009 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP7Q93009 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP7Q93009 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP7Q93009 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP7Q93009 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP7Q93009 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP7Q93009 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP7Q93009 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP7Q93009 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
USP7Q93009 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP7Q93009 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP7Q93009 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP7Q93009 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP7Q93009 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP7Q93009 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP7Q93009 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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