Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLP1Q92989 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLP1Q92989 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms