Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC4Q92889 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC4Q92889 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms