Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms