Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHF3Q92576 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms