Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC12Q8WVT3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12Q8WVT3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms