Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBR1Q8WVP7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBR1Q8WVP7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1Q8WVP7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms