Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX29Q8TEQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms