Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GNPDA2Q8TDQ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNPDA2Q8TDQ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms