Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BEST4Q8NFU0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms