Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACVR1CQ8NER5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVR1CQ8NER5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ACVR1CQ8NER5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms