Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PIK3C3Q8NEB9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms