Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM35BQ8NCS4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms