Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD1Q8NBU5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATAD1Q8NBU5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATAD1Q8NBU5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms