Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL23Q8NBE8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL23Q8NBE8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms