Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TC2NQ8N9U0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TC2NQ8N9U0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms