Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ANKRD42Q8N9B4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms