Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNPLA1Q8N8W4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms