Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMNTD2Q8IXW0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMNTD2Q8IXW0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms