Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC65Q8IXS2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC65Q8IXS2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms