Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL3Q8IVW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL3Q8IVW4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms