Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJLQ8IV13 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJLQ8IV13 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms