Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS6Q8IU80 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS6Q8IU80 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms