Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB11FIP4Q86YS3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms