Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GATAD2AQ86YP4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms