Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRTM3Q86VH5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRTM3Q86VH5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRTM3Q86VH5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms