Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC84Q86UT8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms