Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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