Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RUFY3Q7L099 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms