Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZD4Q76G19 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZD4Q76G19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms