Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H2AFVQ71UI9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms