Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LIAT1Q6ZQX7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LIAT1Q6ZQX7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms