Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMIGD1Q6UXZ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMIGD1Q6UXZ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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