Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASP12Q6UXS9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms