Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBR1LQ6UX01 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBR1LQ6UX01 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBR1LQ6UX01 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBR1LQ6UX01 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMBR1LQ6UX01 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMBR1LQ6UX01 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMBR1LQ6UX01 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms