Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLPSL2Q6UWE3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms