Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC137Q6PK04 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC137Q6PK04 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms