Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A1Q6PCB7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A1Q6PCB7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A1Q6PCB7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms