Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKN3Q6P5Z2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKN3Q6P5Z2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKN3Q6P5Z2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms