Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAVIN1Q6NZI2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAVIN1Q6NZI2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms