Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms