Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms