Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LCN12Q6JVE5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms