Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDE2Q6IQ49 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms