Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSAPQ6IQ19 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSAPQ6IQ19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSAPQ6IQ19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms