Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD4Q6IC98 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms