Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCAPH2Q6IBW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPH2Q6IBW4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms