Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD40Q6AI12 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD40Q6AI12 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms