Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPECC1LQ69YQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms