Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUPD1Q68J44 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUPD1Q68J44 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms